【明智あんな】は、マコトミライタウンに暮らす14歳の中学２年生！誕生日に現れた妖精【ポチタン】とお部屋にあったペンダントに導かれて2027年から1999年のまことみらい市にタイムスリップ…！そこで出会ったのは、名探偵に憧れている14歳の女の子【小林みくる】！名探偵プリキュアがみんなの笑顔を推理で守る！「そのナゾ！キュアット解決！」そして、あんなは元の時代に戻ることができるのか…！？
