真夏の新宿を襲う謎の怪現象。それと共に現れた褐色の戦士ムカラ。遼たちサムライトルーパーはヨロイギアで戦うが太刀打ち出来ない。彼はさらに黒い輝煌帝となり、遼と征士をタンザニアに連れ去ってしまう。黒い輝煌帝の鎧に操られ白い輝煌帝との戦いを求めるムカラと、そのの身を案じる許嫁ナリア。圧倒的な力を持つ黒い機皇帝にサムライトルーパー達はなすすべもない。
